基于拓扑结构的度量学习与拓扑传播的miRNA-疾病关联预测算法
所屬分類:技术论文
上傳者:wwei
文檔大?。?span>4377 K
標(biāo)簽: 深度学习 miRNA-疾病关联 度量学习
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文檔介紹:miRNA的突变和异常表达可能导致各种疾病,因此预测miRNA与疾病的潜在相关性对于临床医学和药物研究的发展具有重要意义。拓扑结构是miRNA-疾病预测算法的重要组成部分,然而当前算法并未有效利用拓扑结构导致预测结果并不理想。与此同时,如何有效地融合多源数据也是当前的研究趋势。针对上述问题,提出一种自适应融合异质节点结构信息算法(MMTP),通过利用节点的一阶邻居和元路径诱导网络学习结构特征,并利用度量学习和拓扑传播自适应地融合异质节点结构信息,以提升miRNA-疾病预测精度。5折交叉验证实验结果表明,MMTP在HMDD v3.2数据集上的受试者操作曲线下面积(AUC)为94.81,高于其他模型。并且在基于肾癌的案例研究中,该模型所预测的前30个miRNAs全部得到证实。上述研究证明,所提的MMTP模型可有效预测miRNA-疾病相关性。
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